Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP17L11C9JVI0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP17L11C9JVI0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP17L11C9JVI0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L11C9JVI0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L11C9JVI0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L11C9JVI0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L11C9JVI0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L11C9JVI0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L11C9JVI0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP17L11C9JVI0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L11C9JVI0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L11C9JVI0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L11C9JVI0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L11C9JVI0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L11C9JVI0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L11C9JVI0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L11C9JVI0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.7 ms