Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRDCB7Z8K6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms