Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CYSRT1A8MQ03 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CYSRT1A8MQ03 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CYSRT1A8MQ03 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms