Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC169A6NNP5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC169A6NNP5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC169A6NNP5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms