Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAC3D1A6NKF1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAC3D1A6NKF1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAC3D1A6NKF1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAC3D1A6NKF1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAC3D1A6NKF1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAC3D1A6NKF1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAC3D1A6NKF1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAC3D1A6NKF1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SAC3D1A6NKF1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAC3D1A6NKF1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAC3D1A6NKF1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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