Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf118A6NHY6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf118A6NHY6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms