Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNDIG1LA6NDD5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYNDIG1LA6NDD5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNDIG1LA6NDD5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms