Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL33A6NCF5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL33A6NCF5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL33A6NCF5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms