Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
VPS37CA5D8V6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
VPS37CA5D8V6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS37CA5D8V6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms