Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A4D1N5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
A4D1N5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A4D1N5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A4D1N5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
A4D1N5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A4D1N5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
A4D1N5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A4D1N5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
A4D1N5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A4D1N5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A4D1N5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A4D1N5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A4D1N5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A4D1N5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A4D1N5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
A4D1N5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
A4D1N5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
A4D1N5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A4D1N5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
A4D1N5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
A4D1N5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
A4D1N5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A4D1N5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A4D1N5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
A4D1N5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A4D1N5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A4D1N5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
A4D1N5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A4D1N5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
A4D1N5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
A4D1N5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A4D1N5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
A4D1N5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
A4D1N5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
A4D1N5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4D1N5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4D1N5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4D1N5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4D1N5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4D1N5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4D1N5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4D1N5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4D1N5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4D1N5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A4D1N5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4D1N5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4D1N5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4D1N5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4D1N5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4D1N5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4D1N5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4D1N5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4D1N5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4D1N5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4D1N5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A4D1N5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4D1N5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4D1N5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4D1N5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4D1N5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4D1N5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4D1N5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4D1N5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4D1N5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A4D1N5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A4D1N5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A4D1N5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A4D1N5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A4D1N5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A4D1N5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
A4D1N5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A4D1N5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
A4D1N5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A4D1N5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A4D1N5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A4D1N5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A4D1N5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A4D1N5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A4D1N5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
A4D1N5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A4D1N5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms