Protein–RNA interactions for Protein: A1A4G5

LNP1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNP1A1A4G5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNP1A1A4G5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNP1A1A4G5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNP1A1A4G5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNP1A1A4G5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNP1A1A4G5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNP1A1A4G5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNP1A1A4G5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNP1A1A4G5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms