Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
A0A0U1RRA0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
A0A0U1RRA0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms