Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KLF12Q9Y4X4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms