Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXD3Q9UJU5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms