Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD1Q9UIS9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms