Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO3A1Q9UIG8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms