Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAI1Q9UI46 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DNAI1Q9UI46 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.8 ms