Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FAM8A1Q9UBU6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM8A1Q9UBU6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms