Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms