Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COPG2Q9UBF2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms