Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD5Q9P267 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD5Q9P267 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms