Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA2D2Q9NY47 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms