Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL28Q9NXS3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL28Q9NXS3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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