Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG3Q9NT62 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms