Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SALL1Q9NSC2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms