Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSU72Q9NP77 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms