Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARFGAP3Q9NP61 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms