Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ELL3Q9HB65 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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