Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB58

SP110, Sp110 nuclear body protein, humanhuman

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Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110Q9HB58 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP110Q9HB58 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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