Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM31Q9BZY9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms