Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCP2Q9BX26 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms