Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
YIPF4Q9BSR8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms