Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NICN1Q9BSH3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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