Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM79Q9BSE2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM79Q9BSE2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM79Q9BSE2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM79Q9BSE2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM79Q9BSE2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM79Q9BSE2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM79Q9BSE2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM79Q9BSE2 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM79Q9BSE2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM79Q9BSE2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM79Q9BSE2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM79Q9BSE2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM79Q9BSE2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM79Q9BSE2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM79Q9BSE2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms