Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms