Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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GFI1Q99684 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GFI1Q99684 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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GFI1Q99684 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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GFI1Q99684 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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GFI1Q99684 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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GFI1Q99684 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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GFI1Q99684 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GFI1Q99684 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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