Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NAP1L3Q99457 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NAP1L3Q99457 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms