Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT140Q96RY7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT140Q96RY7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms