Protein–RNA interactions for Protein: Q96IL0

APOPT1, Apoptogenic protein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOPT1Q96IL0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOPT1Q96IL0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms