Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SMIM12Q96EX1 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms