Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SGF29Q96ES7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGF29Q96ES7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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