Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C18orf8Q96DM3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2267.1 ms