Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A3Q93084 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms