Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 COL11A1-210ENST00000512756 5442 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ATP2B2-202ENST00000360273 8962 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
COPS9Q8WXC6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms