Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SEMA6DQ8NFY4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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