Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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CSNK2A3Q8NEV1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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CSNK2A3Q8NEV1 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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CSNK2A3Q8NEV1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CSNK2A3Q8NEV1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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