Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
LINC00612Q8N6U2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms