Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLDN19Q8N6F1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms