Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL3Q8IVW4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms