Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZRN4Q6ZMN7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms